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申请/专利权人：上海生物芯片有限公司
摘要：本发明提供一种信号通路PCR芯片数据分析系统、本地计算机设备及云平台，通过信号通路PCR芯片的原始Ct值文件、芯片布局文件、分组文件以及组别对比文件以及设置的个性化参数对PCR芯片数据自动化进行标准化、统计分析、可视化以及功能分析并最终生成报告结果，该数据分析系统最终生成的报告中，统计分析以及可视化结果可直接用于文章发表，生物医学检测报告等。
主权项：1.一种信号通路PCR芯片数据分析系统，其特征在于，所述系统包括：数据预处理模块，用于根据导入的芯片布局文件在导入的原始Ct值文件中获取各样品的各通路基因以及关键基因的Ct值，并对其进行预处理，以获得对应各样品中各基因的标准化数据；其中，所述关键基因包括：内参基因、质控、阴参以及阳参；所述标准化数据包括：Ct值、ΔCt值以及相对表达量；数据统计分析模块，连接所述数据预处理模块，用于根据导入的分组文件以及组别对比文件，对对应各样品中各基因的标准化数据进行统计分析以获得统计分析结果，并将所述统计分析结果可视化获得可视化结果；数据功能分析模块，连接所述数据统计分析模块，用于基于所述统计分析结果对差异基因进行string网站分析以及对各通路基因进行pathwaymap分析，以获得差异基因分析结果以及通路基因分析结果；最终分析结果生成模块，连接所述数据统计分析模块以及数据功能分析模块，用于基于所述统计分析结果、可视化结果、差异基因分析结果以及通路基因分析结果获得最终分析结果；其中，所述数据功能分析模块包括：string网站分析单元，用于基于爬虫技术，在string网站上获得各差异基因的ppi蛋白以及差异基因ppi，并下载相应图片；KEGGpathwaymap分析单元，用于以颜色变化的形式将各组所对应的各通路基因的表达水平、差异变化以及显著水平中的一种或多种映射于kegg的pathwaymap图上，并获得与各通路基因相关的pathway信息。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 上海生物芯片有限公司 信号通路PCR芯片数据分析系统、本地计算机设备及云平台
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