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用于甲基化测序的单细胞全基因组文库 

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申请/专利权人:俄勒冈健康科学大学;伊鲁米那股份有限公司

摘要:本文提供了制备用于确定来自多个单细胞的核酸的甲基化状态的测序文库的方法。本发明方法将分开‑合并式组合指标化与亚硫酸氢盐处理技术组合,以快速、准确并且廉价地表征大量单细胞的甲基化概况。

主权项:1.一种制备用于确定来自多个单细胞的核酸的甲基化状态的测序文库的方法,该方法包括:a提供来自多个细胞的分离的细胞核;b使这些分离的细胞核经历化学处理以产生耗尽核小体的细胞核,同时保持这些分离的细胞核的完整性;c将这些耗尽核小体的细胞核的子集分配到包含转座体复合物的第一多个区室中,其中每个区室中的该转座体复合物包含与其他区室中的第一指标序列不同的第一指标序列;d将耗尽核小体的细胞核的这些子集中的核酸片段化为多个核酸片段,并且将这些第一指标序列掺入这些核酸片段的至少一条链中,以产生指标化细胞核;e将这些指标化细胞核组合以产生合并的指标化细胞核;f将这些合并的指标化细胞核的子集分配到第二多个区室中,并且使这些指标化细胞核经历处理,以鉴定甲基化的核苷酸和产生经处理的核酸片段;g通过使用多个引物的线性扩增来扩增每个区室中的这些经处理的核酸片段以产生扩增的片段-衔接子分子,这些引物在5'末端包含通用核苷酸序列,并且在3'末端包含随机核苷酸序列;h将第二指标序列掺入这些扩增的片段-衔接子分子中以产生双指标片段-衔接子分子,其中在每个区室中的该第二指标序列不同于其他区室中的第二指标序列;以及i将这些双指标片段-衔接子分子组合,从而产生用于确定来自该多个单细胞的核酸的甲基化状态的测序文库。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 俄勒冈健康科学大学 伊鲁米那股份有限公司 用于甲基化测序的单细胞全基因组文库

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