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基因组精简的恶臭假单胞菌菌株 

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申请/专利权人:浙江大学

摘要:本发明涉及微生物基因工程领域,尤其涉及基因组精简的恶臭假单胞菌菌株。本发明提供的恶臭假单胞菌基因组精简菌株BGR4是将PseudomonasputidaB6‑2中的4个原噬菌体、2个基因组岛和3个冗余的核酸酶编码基因无痕敲除后得到的菌株。相比于菌株B6‑2,菌株BGR4具有更精简的基因组,且基因组精简之后,菌株BGR4的一系列性状得到增强。因此,该基因组精简菌株作为生物修复底盘细胞具有良好的应用前景。

主权项:1.基因组精简的恶臭假单胞菌,其特征在于,其原始菌株为保藏编号为CCTCCM207029的恶臭假单胞菌B6-2菌株,且其基因组中:I型限制性内切酶编码基因hsdR和原噬菌体1被敲除;或者I型限制性内切酶编码基因hsdR、原噬菌体1和原噬菌体2被敲除;或者I型限制性内切酶编码基因hsdR、原噬菌体1、原噬菌体2、原噬菌体3、原噬菌体4、Ι型脱氧核糖核酸酶编码基因endA-1和Ι型脱氧核糖核酸酶编码基因endA-2被敲除;或者hsdR、原噬菌体1、原噬菌体2、原噬菌体3、原噬菌体4、Ι型脱氧核糖核酸酶编码基因endA-1、Ι型脱氧核糖核酸酶编码基因endA-2、基因组岛1和基因组岛2被敲除;所述原噬菌体1位于恶臭假单胞菌B6-2基因组的1,232,367~1,298,675位核苷酸;所述原噬菌体2位于恶臭假单胞菌B6-2基因组的1,750,781~1,810,426位核苷酸;所述原噬菌体3位于恶臭假单胞菌B6-2基因组的4,198,166~4,235,943位核苷酸;所述原噬菌体4位于恶臭假单胞菌B6-2基因组的146,101~169,028位核苷酸;所述基因组岛1位于恶臭假单胞菌B6-2基因组的692,808~721,896位核苷酸;所述基因组岛2位于恶臭假单胞菌B6-2基因组的2,464,973~2,506,513位核苷酸;所述I型限制性内切酶编码基因hsdR的核酸序列如SEQIDNO:1所示;所述Ι型脱氧核糖核酸酶编码基因endA-1的核酸序列如SEQIDNO:2所示;所述Ι型脱氧核糖核酸酶编码基因endA-2的核酸序列如SEQIDNO:3所示。

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