买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！

申请/专利权人：武汉大学

摘要：本发明公开了一种基于集成多组学分析预测QTL内候选基因的方法和系统，所述方法包括：选取母本和父本，将所述母本和父本杂交获得F1代，单粒传种构建出重组自交系RILs；将所述重组自交系RILs进行测序并构建遗传图谱，并进行QTL分析，获得QTL区间及QTLs区间位置信息；于公开数据库搜集目标性状相关的已知基因，并与所述QTLs区间位置信息进行比较，获得候选基因；将所述候选基因与父母本蛋白序列库进行比对，获得存在差异的基因；后基因分型，获取各分型群对应的性状并进行检验；对所述存在差异的基因进行公共表达数据库佐证和转基因验证，获得QTL内候选基因。该方法集成多组学分析方法能有效锁定候选基因，操作便捷。

主权项：1.一种基于集成多组学分析预测QTL内候选基因的方法，其特征在于，所述方法包括：选取母本和父本，将所述母本和所述父本杂交获得F1代，将所述F1代自交获得F2代，后将所述F2代进行单粒传种构建出重组自交系RILs；并将所述父本和所述母本所有的氨基酸序列汇总到一起做出父母本蛋白序列库；将所述重组自交系RILs进行测序并采用binmap的方式对所有标记进行bin的划分，构建遗传图谱，并进行QTL分析，获得QTL区间及QTLs区间位置信息；于公开数据库搜集目标性状相关的已知基因，并与所述QTLs区间位置信息进行比较，获得候选基因，具体包括：于公开数据库搜集目标性状相关的已知基因，获得这些已知基因后，通过这些基因MSU7.0ID提取它们位置信息，并根据这些基因实际物理位置信息，与鉴定到的QTLs区间位置信息进行比较：若所述QTL区间内有所述已知基因，所述已知基因即为候选基因；若所述QTL区间内无所述已知基因，通过这些已知基因的MSU7.0ID分别提取它们的蛋白序列去比对QTLs区间内的基因的蛋白序列去发掘QTL区间内已知基因的同源基因，作为候选基因；将所述候选基因与所述父母本蛋白序列库进行比对，获得所述候选基因与所述父母本之间存在差异的基因；将所述存在差异的基因进行基因分型，获取各分型群对应的性状并进行student检验；并对所述存在差异的基因进行公共表达数据库佐证和转基因验证，获得QTL内候选基因。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 武汉大学 一种基于集成多组学分析预测QTL内候选基因的方法和系统