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一种荧光素酶与催化底物的结构模型及其构建方法和应用 

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申请/专利权人:郑州轻工业大学

摘要:本发明属于生物化学技术领域,具体为一种荧光素酶与催化底物的结构模型及其构建方法和应用,构建方法,其特征在于,所述构建方法包括以下步骤:删除全长GLuc结构氨基酸序列中除1‑97区域外的其余结构构建tGLuc初始模型;对tGLuc初始模型进行稳定得到tGLuc初始模型;将CTZ对接于tGLuc的催化腔内,得到初始tGLuc‑CTZ复合体结构模型,进行稳定得到tGLuc‑CTZ复合体结构模型。通过对所述复合体结构模型内的tGLuc进行虚拟突变或对CTZ进行化学修饰,可计算分析突变残基或化学修饰基团对tGLuc与CTZ间结合能的影响情况,并预测发光光谱特征,实现虚拟筛选。

主权项:1.一种片段截短型荧光素酶与催化底物结构模型的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:删除全长荧光素酶GaussiaLuciferase结构氨基酸序列中除1-97区域外的其余结构构建tGLuc初始模型;基于分子动力学模拟对tGLuc初始模型进行平衡,以实现tGLuc初始模型的稳定,得到tGLuc模型;将催化底物coelenterazine对接于tGLuc模型的催化腔内,得到初始tGLuc-CTZ复合体结构模型;基于分子动力学模拟对tGLuc初始模型进行平衡,以实现对初始tGLuc-CTZ复合体结构模型的稳定,得到tGLuc-CTZ复合体结构模型。

全文数据:

权利要求:

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