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基于单细胞测序数据的肿瘤细胞重要通路及标志物识别方法 

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申请/专利权人:高精(浙江安吉)精准医学科技有限公司

摘要:本发明涉及肿瘤单细胞测序技术领域,尤其涉及基于单细胞测序数据的肿瘤细胞重要通路及标志物识别方法以解决群体水平上肿瘤相关通路识别方法会掩盖肿瘤微环境内部细胞的异质性这一问题。本发明方法可以快速识别肿瘤细胞中的关键通路,并发现潜在的肿瘤细胞生物标志物,为单细胞测序技术应用于肿瘤细胞相关通路识别和肿瘤细胞标志物的发现提供了参考。

主权项:1.一种基于单细胞测序数据的肿瘤细胞重要通路及标志物的识别方法,其特征在于,包括肿瘤细胞通路富集模块、重要通路鉴定模块与基因重要性量化模块:所述肿瘤细胞通路富集模块用于获取肿瘤细胞中的重要通路候选集合,从肿瘤组织中识别肿瘤细胞和正常细胞,对正常细胞和肿瘤细胞分组,对不同组别中差异表达的基因进行富集分析,从而获取重要通路候选集合;所述重要通路鉴定模块通过对重要通路候选集合中的每条通路建立RF-通路模型,基于模型识别重要通路;所述基因重要性量化模块用于在全局和特定通路中量化基因的重要性,对量化结果排序,获取重要基因作为标志物。

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权利要求:

百度查询: 高精(浙江安吉)精准医学科技有限公司 基于单细胞测序数据的肿瘤细胞重要通路及标志物识别方法

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