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一种微滴式数字PCR荧光信号处理方法 

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申请/专利权人:深圳麦科田生物医疗技术股份有限公司

摘要:本发明公开了一种微滴式数字PCR荧光信号处理方法,包括:对原始荧光信号进行滤波得到第一荧光信号;基于第一荧光信号识别微滴参数;基于微滴参数和预设微滴过滤条件过滤微滴;对过滤后的微滴进行聚类从而得到第一阈值;基于第一阈值统计阴性微滴和阳性微滴的个数,并计算待测物的浓度。本发明提出的一种微滴式数字PCR荧光信号处理方法,可以准确地从荧光信号中提取出微滴信号、并准确的区分阴性微滴和阳性微滴,从而实现了样品浓度的准确计算。

主权项:1.一种微滴式数字PCR荧光信号处理方法,其特征在于,包括:S1、对原始荧光信号进行滤波得到第一荧光信号;S2、基于第一荧光信号识别微滴参数;S3、基于微滴参数和预设微滴过滤条件过滤微滴;S4、对过滤后的微滴进行聚类从而得到第一阈值,其中,所述第一阈值是在分割后的阴性微滴荧光强度和阳性微滴荧光强度的类间方差最大时确定的;S5、基于第一阈值统计阴性微滴和阳性微滴的个数,并计算待测物的浓度;其中,S2、所述基于第一荧光信号识别微滴参数,具体包括:S21、对第一荧光信号进行本底估计得到本底值;S22、基于预设偏差和本底值进行第一荧光信号波峰定位;S23、基于波峰确定微滴荧光强度和波峰距离,从而得到至少包括微滴体积和微滴间距的微滴参数;其中,S22、所述基于预设偏差和本底值进行第一荧光信号波峰定位,具体包括:基于本底值和预设偏差,将第一荧光信号分为若干信号段,每个信号段中的最大值为波峰;其中,S21、所述对第一荧光信号进行本底估计得到本底值,具体包括:构建第一荧光信号数据的第一直方图;将直方图中最大的频数对应的荧光强度值作为本底信号的荧光强度均值μ,则得到偏差R=μ-Fmin,其中,Fmin为所有荧光强度的最小值;对在[μ-R,μ+R]区间内的荧光数据进行线性拟合得到参数a和b,则位置T处的本底值为Fb=aT+b;其中,S23、所述基于波峰确定微滴荧光强度和波峰距离,包括:对波峰进行曲线拟合;具体包括:基于预设个数N选取波峰位置前后各N个荧光强度值,将取值顺序和荧光强度值组成2N+1个坐标点,并进行二次曲线拟合或高斯曲线拟合;基于拟合后得到的参数计算得到微滴荧光强度;波峰前后小于微滴荧光强度的预设阈值的位置作为两个端点,两个端点之间的距离作为波峰宽度。

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权利要求:

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