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一种基于3D-dPCR检测向日葵茎溃疡病菌的方法 

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申请/专利权人:乌鲁木齐海关技术中心

摘要:本发明属于农业和植物检疫领域,具体涉及一种基于3D‑dPCR检测向日葵茎溃疡病的方法,包括以下步骤:S1提取茎溃疡病菌DNA;S2提取向日葵样品DNA;S3人工模拟带菌向日葵种子;S4合成引物探针:选择DH‑FDH‑R为引物、DH‑Pr为探针合成;所述DH‑F核酸序列为:5′‑CGCTTATCTCTTACACCAAAACCCT‑3′;所述DH‑R核酸序列为:5′‑GCAGCTATTGAAACAGCTCATCTG‑3′;所述DH‑Pr核酸序列为:5′‑ATGCACCCACCGCACTCCTGC‑3′;S5构建目的基因质粒;S63D‑dPCR反应。该方法基于3D‑dPCR检测技术,通过改变实验条件,大大降低了向日葵茎溃疡病菌的检测限,在海关等检测场景中具有很强的使用价值。

主权项:1.一种基于3D-dPCR检测向日葵茎溃疡病菌的方法,其特征在于,包括以下步骤:S1提取茎溃疡病菌DNA:将茎溃疡病菌菌株培养,选取纯化的单菌落菌块,提取其植物基因组DNA,测量DNA浓度和纯度后保存备用;S2提取向日葵样品DNA:取向日葵样品,研磨成粉后使用植物基因组DNA提取试剂盒进行提取植物基因组DNA,测量DNA浓度和纯度后保存备用;S3人工模拟带菌向日葵种子:取向日葵样品漂洗消毒后置于纯化好的向日葵茎溃疡菌中,培养至带有目的菌丝的种子后保存;S4合成引物探针:选择DH-FDH-R为引物、DH-Pr为探针合成;所述DH-F核酸序列为:5′-CGCTTATCTCTTACACCAAAACCCT-3′;所述DH-R核酸序列为:5′-GCAGCTATTGAAACAGCTCATCTG-3′;所述DH-Pr核酸序列为:5′-ATGCACCCACCGCACTCCTGC-3′;S5构建目的基因质粒:选取目的核酸序列,合成质粒重组菌,将质粒重组菌活化培养后提取目的基因质粒;S63D-dPCR反应:以目的基因质粒DNA为模板,进行3D-dPCR扩增反应。

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权利要求:

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