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申请/专利权人：西安交通大学

摘要：一种基于语义网技术的组织病理切片语义描述语言的建立及应用方法，其中语义描述语言的建立为：通过建立病理特征描述语言的基本项，包括本体类、对象属性与数据属性，能够表示病理切片中的更大范围的病理特征；在应用上，对组成该表型的的每一个实体、实体的属性、实体之间的关系进行细粒度描述，相较现有工作，能够大大降低表示的歧义性，另外，结合网络本体语言OWL自身具备的检索、推理等功能，能够进一步降低计算机传输、理解、分析复杂病理特征的难度；本发明能够对不同癌种的病理切片中出现的多元病理特征进行描述，实现对病理特征更加完整、精确的表示，为实现病理数据语义互操作性提供基础技术支撑。

主权项：1.一种基于语义网技术的组织病理切片语义描述语言的建立方法，其特征在于：基于网络本体语言OWL，采用本体编辑工具Protégé-OWLeditor，建立病理特征描述语言的基本项，包括本体类、对象属性与数据属性；其中，本体类用于表达相关概念，对象属性用于描述本体类之间的逻辑关系，而数据属性用来存储名称、数值信息；具体包括以下步骤：一、构建本体类所属分支；二、设置对象属性，在本体类中使用对象属性，通过设置属性值为其他类，表示该类与其他类之间的关系：设置对象属性要定义属性域domain和范围range，定义对象属性属性域domain，即规定哪些本体类可以使用该对象属性；定义对象属性属性范围range，即规定哪些本体类可作为该属性的属性值；三、设置数据属性，在本体类中使用数据属性，定义数据属性的属性域domain指规定哪些本体类可以使用该数据属性；定义数据属性的属性范围range指明确属性值的数据类型，包括字符、数值；所述步骤一具体包括：Step1将本体类分为Entity类、Utility类，Entity用于表示病理表型，Utility类用于辅助表示Entity类；Step2对Entity类设置Phenotype、PhysicalEntity子类，令Phenotype用于表示病理切片中的病理表型，PhysicalEntity用于表示组成病理表型的实体，包括细胞，细胞的组成结构包括细胞质、细胞核、核仁，细胞的化学物质包括细胞的产物或储存物，组织及相关的解剖学结构包括管或腔；Step3将Step2中的PhysicalEntity分为Substance、NormalEntity与Tumor子类，令Substance用于表示病理切片中出现的化学物质，NormalEntity用于表示病理切片中出现的非癌变实体，Tumor用于表示病理切片中出现的癌变实体；Step4将Step3中的NormalEntity进一步分为NormalCell、NormalCellularComponent、NormalAnatomicalEntity子类，令NormalCel用于表示非癌变细胞，NormalCellularComponent用于表示非癌变细胞组成成分，NormalAnatomicalEntity用于表示非癌变的组织或解剖学结构；Step5将Step3中的Tumor进一步分为Parenchyma与Stroma子类，令Parenchyma用于表示肿瘤的实质，Stroma用于表示肿瘤的间质；Step6将Step5中的Parenchyma进一步分为NeoplasticCell、NeoplasticCellularComponent、ParenchymaAnatomicalEntity子类，令NeoplasticCell用于表示肿瘤细胞，NeoplasticCellularComponent用于表示肿瘤细胞的组成成分，ParenchymaAnatomicalEntity用于表示肿瘤组织内部形成的解剖学结构；Step7将Step5中的Stroma进一步分为StromaCell、StromaCellularComponent与StromaAnatomicalEntity子类，令StromaCell表示肿瘤间质的细胞，StromaCellularComponent表示肿瘤间质的组成成分，StromaAnatomicalEntity表示因肿瘤发生发展而增生形成的组织或解剖学结构；Step8将Step2中的Phenotype分为Cellular_Appearances、Product_or_Reserve以及Architectural_Pattern子类，令Cellular_Appearances用于表示细胞表型，Product_or_Reserve用于表示细胞产物与储存物构成的表型，Architectural_Pattern用于表示结构表型；Step9将Step1中的Utility类分为EntityReference、EntityAttribute、Quantification、Relationship；令EntityReference用于表示组成病理表型的实体的实体类型，包括细胞种类、组织类型；令EntityAttribute用于表示实体的特征，包括大小、形状，Quantification用于引入定量信息，对特征进行量化衡量，细化EntityAttribute对实体的特征的表示，Relationship用于表示实体与实体之间的动态关系，包括一个组织对另一个组织的挤压、侵犯或浸润；Step10将Step9中的EntityReference分为CellReference、CellularComponentReference、SubstanceReference与AnatomicalEntityReference子类，令CellReference用于表示细胞类型包括淋巴细胞、红细胞、纤维细胞、不同癌症所对应的肿瘤细胞；CellularComponentReference用于表示细胞组成结构类型，包括细胞的细胞质、细胞的细胞核；令SubstanceReference用于表示细胞的化学物质类型，包括蛋白质、脂肪、铁血红素；令AnatomicalEntityReference用于表示组织或解剖学结构的类型，包括毛细血管、腔。

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