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申请/专利权人:北京诺禾致源科技股份有限公司
摘要:本发明涉及生物信息领域,具体而言,涉及一种刺胞动物门物种基因组Homeobox基因家族鉴定方法、装置、电子设备及存储介质。该方法包括:S1.构建模式生物基因组Homeobox基因家族保守结构域序列的隐马尔可夫模型数据库;S2.提取刺胞动物门物种的基因组候选Homeobox基因;S3.基于Homeobox基因家族保守结构域序列的隐马尔可夫模型数据库,对刺胞动物门物种基因组候选Homeobox基因的蛋白序列进行同源检索;S4.整合同源检索结果,基于比对期望值进行排序,筛选最佳比对。该方法对刺胞动物门物种基因组Homeobox基因家族能够进行全面鉴定,具有通用性,分类效率高,不易出现假阳性。
主权项:1.一种刺胞动物门物种基因组Homeobox基因家族鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:S1.构建模式生物基因组Homeobox基因家族保守结构域序列的隐马尔可夫模型数据库;S2.提取刺胞动物门物种的基因组候选Homeobox基因;S3.基于Homeobox基因家族保守结构域序列的隐马尔可夫模型数据库,对刺胞动物门物种基因组候选Homeobox基因的蛋白序列进行同源检索;S4.整合同源检索结果,基于比对期望值进行排序,筛选最佳比对确定刺胞动物门物种Homeobox基因及家族分类。
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百度查询: 北京诺禾致源科技股份有限公司 一种刺胞动物门物种基因组Homeobox基因家族鉴定方法、装置、电子设备及存储介质
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