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申请/专利权人:上海市皮肤病医院
摘要:本发明公开了一种COL1A1与PDGFB融合基因检测方法,包括:合成COL1A1与PDGFB捕获探针;采用标准方法提取DNA和构建DNA测序文库;扩增DNA测序文库并进行质检;扩增的DNA文库探针杂交捕获;扩增捕获后的DNA测序文库并进行质检;高通量测序和生物信息分析。本发明前期根据COL1A1与PDGFB经常发生融合基因断裂的位置设计DNA探针,通过外显子捕获技术,捕获肿瘤组织样本中发生COL1A1与PDGFB融合的基因组DNA,再采用高通量测序技术对其中的融合基因DNA进行测序检测。
主权项:1.一种基于捕获测序的COL1A1-PDGFB融合基因检测方法,其特征在于,包括:1合成COL1A1与PDGFB捕获探针;2采用标准方法提取DNA和构建DNA测序文库;3扩增DNA测序文库并进行质检;4扩增的DNA文库探针杂交捕获;5扩增捕获后的DNA测序文库并进行质检;6高通量测序和生物信息分析。
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权利要求:
百度查询: 上海市皮肤病医院 一种基于捕获测序的COL1A1-PDGFB融合基因检测方法
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