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一种基于RBS算法的DNA存储编码优化方法 

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申请/专利权人:大连大学

摘要:本发明公开了一种基于RBS算法的DNA存储编码优化方法,该方法首先对二进制数据进行转换,转换为碱基序列;根据碱基频率将序列划分为三个文件。其次对三个文件分别采用了数据块合并、RH混合编码和字符合并三种方式进行编码。最后,采用轮转编码将二进制数据转换为碱基序列,并且分割为120nt一组的短序列。本发明生成的码字在DNA存储中信息存储密度更高,编码质量更好,提高了DNA存储的高效性、实用性和稳定性。

主权项:1.一种基于RBS算法的DNA存储编码优化方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤1:将DNA存储编码文件转换为二进制数据流,再将每位数据进行随机异或操作;步骤2:将二进制数据流转换为碱基序列;步骤3:检测碱基序列中各个碱基的频率,对碱基频率进行排序,频率排序存入Buffer文件中;步骤4:将碱基序列进行分割,分割方法如下:1首先将第一频率碱基的位置置为“1”,其余频率碱基的位置置为“0”,生成First_frequency文件;2再将第一频率碱基删除后,将第二频率碱基的位置置为“1”,第三、四频率碱基的位置置为“0”,生成Second_frequency文件;3再将第二频率碱基删除后,将第三频率碱基和第四频率碱基以字符的形式记录,生成Other_frequency文件;步骤5:对First_frequency文件进行数据块合并处理;步骤6:对Second_frequency文件进行RH混合编码处理;步骤7:对Other_frequency文件进行字符合并处理;步骤8:对所有文件进行编码,转换为碱基序列,将碱基序列分割为短序列。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 大连大学 一种基于RBS算法的DNA存储编码优化方法

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