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含独特分子标签序列的转座酶复合体及其应用 

申请/专利权人:华中农业大学

申请日:2020-10-21

公开(公告)日:2024-04-19

公开(公告)号:CN112251422B

主分类号:C12N9/12

分类号:C12N9/12;C07K19/00;C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.04.19#授权;2021.02.09#实质审查的生效;2021.01.22#公开

摘要:本发明公开了一种含独特分子标签序列的转座酶复合体及其应用,所述转座酶复合体为由寡聚核苷酸接头和转座酶组装形成的复合体;利用本发明所述的含有UMI标签的转座酶复合体构建的二代测序文库,能够有效区分转座酶插入重复事件和PCR导致的重复读段,提高了测序数据的利用率、序列变异及其频率鉴定的可靠性、基因表达和染色质可及性定量的准确性,以及鉴定DNA结合蛋白的足迹的敏感性。

主权项:1.一种含独特分子标签序列的转座酶复合体,其特征在于:所述转座酶复合体为由寡聚核苷酸接头和转座酶组装形成的复合体;转座酶为Tn5转座酶;且所述寡聚核苷酸接头的第一链从5′端到3′端依次包括通用接头序列、间隔序列、UMI标签序列或者UMI复合标签序列、间隔序列、条码序列和ME序列,间隔序列由长度为0~20bp的可替换的非随机的序列组成,GC含量为25%-75%;ME序列为用于与转座酶结合的序列;所述寡聚核苷酸接头的第一链的表达式为:[]cgacgctcttccgatct{}AGATGTGTATAAGAGACA,其中,cgacgctcttccgatct为通用接头序列的末端,通用接头序列[]cgacgctcttccgatct的长度为10~50个核苷酸;{}为UMI标签序列或UMI复合标签序列,UMI复合标签由多个依次连接的UMI标签序列组成且UMI标签序列为一种或多种;或者由多个由间隔序列分隔的UMI标签序列组成且UMI标签序列为一种或多种;UMI标签序列长度为2~50个核苷酸;UMI复合标签序列长度为4~50个核苷酸;为条码序列,其长度为0~50个核苷酸,用于调节碱基平衡;AGATGTGTATAAGAGACA为ME序列;所述寡聚核苷酸接头的第二链为包含ME序列的互补序列。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 华中农业大学 含独特分子标签序列的转座酶复合体及其应用

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