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【发明授权】一种菌阳活动性肺结核风险评估模型的构建方法与应用_东莞市滨海湾中心医院(东莞市太平人民医院、东莞市第五人民医院)_202310961571.0 

申请/专利权人:东莞市滨海湾中心医院(东莞市太平人民医院、东莞市第五人民医院)

申请日:2023-08-01

公开(公告)日:2024-06-11

公开(公告)号:CN116994646B

主分类号:G16B20/00

分类号:G16B20/00;G16B30/10;G16B40/20;G16H50/20

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.06.11#授权;2023.11.21#实质审查的生效;2023.11.03#公开

摘要:本发明提供了一种菌阳活动性肺结核风险评估模型的构建方法与应用,属于生物技术领域。本发明提供一组用于区分菌阳活动性肺结核和非活动性肺结核的标志物,所述标志物包括GBP5、WARS和FCGR1B。本发明从基因及分子层面出发,通过对肺结核全血标本RNA序列的表达矩阵进行富集分析,筛选得到标志物GBP5、WARS和FCGR1B,并通过三个基因标志物构建得到菌阳活动性肺结核风险评估模型,该预测模型能够显著提高菌阳活动性肺结核风险评估效能,具有更高的准确性和敏感性,对肺结核患者的早期诊断和治疗提供更准确的指导。

主权项:1.一种菌阳活动性肺结核风险评估模型的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)收集包含菌阳活动性肺结核和非活动性肺结核全血基因样本数据集并进行归一化,通过R语言进行差异基因分析归一化后的样本,得差异基因;(2)对步骤(1)的差异基因进行GO富集分析、KEGG富集分析、GSEA富集分析和DO分析;(3)采用R语言对差异基因进行LASSO回归分析,得关键基因;(4)通过STRING数据库对差异基因进行蛋白质相互作用网络分析,并使用Cytoscape软件中Cytohubba插件中MCC算法筛选得到中心基因;(5)将关键基因和中心基因取交集,得到评估基因并构建得到菌阳活动性肺结核风险评估模型;所述评估基因为GBP5、WARS和FCGR1B;所述菌阳活动性肺结核风险评估模型为:F=0.004373*P^2-0.0000131*P^3-0.4544095*P+15.0262631;所述P为列线图Point分数;所述P=25*WARS-5.8*GBP5+13.2*FCGR1B-220.6;所述WARS为基因WARS的表达量;所述GBP5为基因GBP5的表达量;所述FCGR1B为基因FCGR1B的表达量。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 东莞市滨海湾中心医院(东莞市太平人民医院、东莞市第五人民医院) 一种菌阳活动性肺结核风险评估模型的构建方法与应用

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