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【发明公布】一种基于帕累托集成剪枝的单细胞数据注释方法及系统_吉林大学_202410016998.8 

申请/专利权人:吉林大学

申请日:2024-01-05

公开(公告)日:2024-06-14

公开(公告)号:CN118197427A

主分类号:G16B40/00

分类号:G16B40/00;G06N3/082;G06N3/096

优先权:

专利状态码:在审-公开

法律状态:2024.06.14#公开

摘要:本公开提供了一种基于帕累托集成剪枝的单细胞数据注释方法。该方法包括参考数据集和待注释数据集的预处理;基于多种特征选择方法和机器学习方法的基学习器集合的训练;利用帕累托集成剪枝方法选取最优的基学习器子集;利用选取出来的基学习器子集对待注释数据集进行数据;将子集中每个基学习器的注释结果集成在一起,生成最终的注释。以此方式,基学习器利用参考数据集对每种细胞类型的特征进行学习,并利用帕累托剪枝算法对基学习器进行筛选,提取出最优子集,集成了各个基学习器的优势,同时集成剪枝算法也避免了单一算法在部分场景的应用局限,拓宽了细胞注释方法的应用场景。

主权项:1.一种基于帕累托集成剪枝的单细胞数据注释方法,其特征在于,包括:S1、获取单细胞数据参考数据集和待注释数据集;S2、对所述单细胞数据参考数据集和所述待注释数据集进行预处理;S3、基于特征选择方法和机器学习方法构建基学习器集合,通过所述基学习器集合对所述单细胞数据参考数据集进行训练;S4、利用帕累托集成剪枝方法在所述基学习器集合中选取最优基学习器子集;S5、利用选取出来的所述最优基学习器子集对所述待注释数据集进行注释,得到所述最优基学习器子集中的每个基学习器的注释结果;S6、将所述最优基学习器子集中的每个基学习器的注释结果集成在一起,生成最终的单细胞数据注释结果。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 吉林大学 一种基于帕累托集成剪枝的单细胞数据注释方法及系统

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