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一种基于Sanger测序检测遗传性白化病的方法 

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申请/专利权人:中山大学附属第七医院(深圳)

摘要:本发明提供了一种基于Sanger测序检测遗传性白化病的方法,采用二代测序方法对患者进行全外显子测序,筛选出TYR基因两个可疑突变位点,采用一代测序技术在患者父母外周血DNA进行Sanger测序验证,并应用生物信息学SIFT和Polyphen‑2等功能预测软件进行蛋白功能预测,本发明的有益效果在于:本发明使用设计的引物,采用Sanger测序的方法对该病例的家系进行详细的TYR基因突变检测,确定两个突变为患者白化病的遗传因素,对两个可疑致病位点进行Sanger测序验证,患者病因最终得到确诊,并确认父母双方为TYR基因的杂合突变携带者,为家系的遗传咨询及产前诊断提供理论基础,为日后白化病的遗传咨询和产前诊断增添新的致病位点,为白化病的基因检测提供一种方法。

主权项:1.一种基于Sanger测序检测遗传性白化病的方法,其特征在于,包括如下步骤:S1、获取白化病患者及其无类似症状父母的外周静脉血液样本,每人样本采集量为2ml,用EDTA.K2抗凝剂抗凝;S2、患者DNA采用全外显子测序进行基因检测,针对TYR基因的两个突变位点c.440CG:p.S147*与c.1366+3AT,应用Premier3软件进行引物设计合成;S3、应用Sanger测序对患者和父母进行突变位点验证:反应体系为50μL,包括10×PCR缓冲液5μL,10mmolLdNTPs1μL,TaqDNA聚合酶0.5μL,PCR正向和反向引物100ngμL各1.25μL和2.5μL,DNA模板100ngμL,PCR反应程序:95℃变性5min,94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸30s,进行35次循环,最后72℃延伸7min,结束后4℃保存,PCR扩增后,取PCR反应产物5μL经1.5%琼脂糖凝胶电泳观察产物特异性,扩增产物经DNA纯化试剂盒纯化,进行Sanger测序;S4、测序结果用MutationSurveyorV3.97和Chromas软件进行分析;S5、分析获得结果为:基于Sanger测序验证患者c.1366+3AT突变源于母方,c.440CG:p.S147*突变源于父方。

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