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【发明公布】一种基于时序关联性分析的药物不良反应预测方法_电子科技大学_202410059657.9 

申请/专利权人:电子科技大学

申请日:2024-01-15

公开(公告)日:2024-06-18

公开(公告)号:CN118213089A

主分类号:G16H70/40

分类号:G16H70/40;G16H50/50;G16B15/30;G06F18/22

优先权:

专利状态码:在审-公开

法律状态:2024.06.18#公开

摘要:本发明公开了一种基于时序关联性分析的药物不良反应预测方法,属于生物医学领域。本发明基于患者患病后症状、药物和不良反应的时间序列信息,分析不同时刻下症状、药物和不良反应的时序关联关系,揭示当前时刻的不良反应与前序时刻症状、药物和不良反应的关联程度,并结合症状和药物多属性特征与不良反应间的潜在关系,构建基于时序关联性分析的药物不良反应预测模型,揭示药物不良反应的时序关系。本发明可促进用药安全性研究,也为构建药物不良反应时序预警体系提供数据支持。

主权项:1.一种基于时序关联性分析的药物不良反应预测方法,该方法包括:步骤1:针对特定疾病收集患者的症状、药物和不良反应关系时序数据、收集药物的多属性数据,药物的多属性数据包括:分子结构、靶点、通路、副作用、表型;将患者症状时间序列记为<s0,s1,s2,...,si,...,sn>,si表示ti时刻患者的症状,药物时间序列记为<m0,m1,m2,...,mi,...,mn>,mi表示ti时刻患者为缓解症状si服用的药物,不良反应时间序列记为<r0,r1,r2,...,ri,...,rn>,ri表示ti时刻患者服用缓解症状si的药物mi后引发的不良反应,i∈{0,1,2,...,n},n表示时刻数;收集N个药物,将药物mi的第v个属性特征表示为Lv表示第v个属性的特征维度,v=1,2,...,V;V表示属性数目;步骤2:不同时刻下症状、药物和不良反应的时序关联关系计算;采用如下公式计算ti时刻症状si发生的概率psi|si-1,si-2,...,s0: 其中,psi|si-1,si-2,...,s0表示在t0~ti-1时刻症状时间序列<s0,s1,...,si-1>发生的前提下,ti时刻症状si发生的概率,psi,si-1,si-2,...,s0表示t0~ti的症状时间序列<s0,s1,...,si>发生的概率;采用如下公式计算ti时刻的不良反应ri发生的概率pri|si,mi: 其中,pmi|si表示ti时刻症状si的前提下服用药物mi发生的概率,hsi,mi表示ti时刻下症状si和药物mi与不良反应ri间的映射关系,prj|sj,mj表示tj时刻症状sj和药物mj前提下不良反应rj发生的概率,pmj,sj表示tj时刻症状sj和服用药物mj的联合概率;权重wij表示ti时刻的药物不良反应ri受tj时刻的症状sj和药物mj引发不良反应rj的影响程度,视为时刻ti与时刻tj间时序关联性;步骤3:建立症状和药物多属性特征与不良反应的关系;步骤3.1:通过计算特征间的相似性,构建药物mi第v个属性特征相似性矩阵步骤3.2:针对症状si,根据症状影响的身体部位,获取与症状相关的潜在靶点信息,根据靶点特征间的相似性,构建症状si的靶点特征相似性矩阵步骤3.3:建立与症状si靶点特征相似性矩阵的相互作用关系 其中,表示矩阵第a行的转置,表示矩阵第b行;将视为药物mi第v个属性特征与症状si靶点特征之间相互作用关系;步骤3.4:建立药物mi所有属性和症状si的相互作用关系: 步骤3.5:构建症状和药物多属性特征与不良反应映射的目标函数: 其中,f表示药物和症状的相互作用与不良反应的映射函数,Ωf表示函数f中隐含变量的正则函数;函数f集成了所有时刻的药物mi和症状si的相互作用与不良反应ri间的映射关系;利用随机梯度下降法,对函数f进行优化,实现模型参数更新;步骤4:构建基于时序关联性分析的药物不良反应预测模型; 步骤5:给定患者的症状、药物和不良反应的时序数据,预测患者下一时刻药物不良反应。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 电子科技大学 一种基于时序关联性分析的药物不良反应预测方法

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