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申请/专利权人:四川大学
摘要:本发明公开了一种基于DTN和CRISPRCas12a的电感耦合等离子体质谱核酸检测方法,以至少一种HPV分型的核酸为靶标,所述核酸检测方法以DTN功能化的磁珠为载体,以CRISPR‑Cas12a复合体为靶标识别元件,以金属纳米粒子为报告探针,采用空间分离的CRISPR‑Cas12a对多重目标序列进行特异识别和对应底物探针切割,产生各靶标对应不同浓度的底物探针,通过与DTN功能化磁珠和金属报告探针共孵育,形成三明治结构,磁分离洗涤后,采用ICP‑MS同时采集磁珠表面的金属同位素信号,通过研究同位素信号强度和HPV‑DNA浓度的关系,实现对HPV‑DNA多重准确定量分析。本发明能够对HPV‑DNA进行多重准确定量分析,提高分析结果的准确性和可靠性。
主权项:1.一种基于DTN和CRISPRCas12a的电感耦合等离子体质谱核酸检测方法,其特征在于,以两种或三种HPV分型的核酸为靶标,所述核酸检测方法包括以下步骤:S1:获取金属纳米粒子和磁珠,采用巯基功能化的ssDNA对所述金属纳米粒子进行修饰,获得修饰金属纳米粒子;采用DTN对所述磁珠进行修饰,获得DTN修饰磁珠;当以两种HPV分型的核酸为靶标时,所述金属纳米粒子采用金纳米粒子和银纳米粒子;当以三种HPV分型的核酸为靶标时,所述金属纳米粒子采用金纳米粒子、银纳米粒子和铂纳米粒子;采用巯基功能化的ssDNA对所述金属纳米粒子进行修饰时,采用如SEQIDNO.1所示的DNA序列进行巯基功能化,然后对金纳米粒子进行修饰;采用如SEQIDNO.2所示的DNA序列进行巯基功能化,然后对银纳米粒子进行修饰;采用如SEQIDNO.3所示的DNA序列进行巯基功能化,然后对铂纳米粒子进行修饰;所述DTN为四条单链DNA合成的DNA四面体纳米结构,四条单链DNA分别为生物素修饰的ssDNA-A、生物素修饰的ssDNA-B、生物素修饰的ssDNA-C、ssDNA-D,所述ssDNA-D根据所述金属纳米粒子进行确定,选自ssDNA-DAu、ssDNA-DAg以及ssDNA-DPt;所述ssDNA-DAu的核酸序列如SEQIDNO.7所示,所述ssDNA-DAg的核酸序列如SEQIDNO.8所示,所述ssDNA-DPt的核酸序列如SEQIDNO.9所示;S2:将所述靶标对应CRISPR-Cas12a蛋白与crRNA进行混合,获得具有复合结构的复合物;S3:分别将相同体积不同浓度的HPV分型加入所述复合物中,并向各个混合物中加入Linker底物,在37℃条件下反应30~60min后,加热终止反应,获得反应产物;所述Linker底物根据所述金属纳米粒子选自LinkerAu、LinkerAg、LinkerPt,所述LinkerAu的序列如SEQIDNO.13所示,所述LinkerAg的序列如SEQIDNO.14所示,所述LinkerPt的序列如SEQIDNO.15所示;S4:将所述反应产物与DTN修饰磁珠进行混合孵育,然后进行磁性分离洗涤;S5:向步骤S4获得的产物中加入所述修饰金属纳米粒子进行混合孵育,形成三明治结构;S6:对所述三明治结构进行磁性分离洗涤去除上清液,用王水消解,并用纯水进行稀释,获得质谱采集溶液;S7:对所述质谱采集溶液进行电感耦合等离子体质谱检测,获取其中金属纳米粒子的同位素信号;S8:研究所述同位素信号的强度与HPV分型浓度的关系,获得HPV分型的检测结果。
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权利要求:
百度查询: 四川大学 基于DTN和CRISPR Cas12a的电感耦合等离子体质谱核酸检测方法
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