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深海生物线粒体组装与注释流程 

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申请/专利权人:青岛华大基因研究院

摘要:本发明涉及一种深海生物线粒体基因组组装的方法。该深海生物线粒体基因组组装的方法包括:1获取所述深海生物的cleanreads;2将所述cleanreads进行基因组组装,得到重叠群序列;3将所述重叠群序列与线粒体基因组数据库进行序列比对,基于所述序列比对得到的线粒体重叠群序列与所述cleanreads的比对结果,得到所述深海生物的线粒体reads;4将所述线粒体reads进行线粒体组装,以便获得线粒体组装体。本方法适用于在参考数据较少的样本以及深海生物样本的线粒体基因组组装。

主权项:1.一种深海生物线粒体基因组组装的方法,其特征在于,包括:1获取所述深海生物的cleanreads;2将所述cleanreads进行基因组组装,得到重叠群序列;3将所述重叠群序列与线粒体基因组数据库进行序列比对,基于所述序列比对得到的线粒体重叠群序列与所述cleanreads的比对结果,得到所述深海生物的线粒体reads;4将所述线粒体reads进行线粒体组装,以便获得线粒体组装体。

全文数据:

权利要求:

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