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申请/专利权人：国家超级计算天津中心

摘要：本公开实施例涉及一种基于氧自由基的关系确定方法、装置、设备及介质，其中该方法包括：将目标水通道蛋白模型，插入目标水通道蛋白模型对应的目标膜模型中，得到细胞膜模型；统计不同预设跨膜参数下，待处理氧自由基穿过细胞膜模型中的目标水通道蛋白模型的统计数量；其中，预设跨膜参数包括：细胞膜模型两侧的跨膜电压、细胞膜模型两侧的氧自由基浓度差中的至少一个；根据预设跨膜参数和统计数量，确定参数数量关系。本公开实施例，以跨膜电压、氧自由基浓度中的至少一个作为自变量，确定相应的统计数量，进而实现了参数数量关系的构建，基于该参数数量关系能够定量的对水通道蛋白将氧自由基转运入细胞的生物过程进行分析和计算。

主权项：1.一种基于氧自由基的关系确定方法，其特征在于，包括：将目标水通道蛋白模型，插入所述目标水通道蛋白模型对应的目标膜模型中，得到细胞膜模型；其中，所述目标水通道蛋白模型为模拟目标水通道蛋白的模型，所述目标膜模型为模拟细胞膜中的脂质膜部分的模型；统计不同预设跨膜参数下，待处理氧自由基穿过所述细胞膜模型中的所述目标水通道蛋白模型的统计数量；其中，所述预设跨膜参数包括：所述细胞膜模型两侧的跨膜电压、所述细胞膜模型两侧的氧自由基浓度差中的至少一个；根据所述预设跨膜参数和所述统计数量，确定参数数量关系；其中，在所述得到细胞膜模型之前，所述方法还包括：若目标水通道蛋白的晶体结构未知，则将组成所述目标水通道蛋白的目标氨基酸输入结构预测程序中，得到预测的初始晶体结构；切除所述初始晶体结构中的前端子结构和后端子结构，得到中间晶体结构，若基于所述中间晶体结构确定的可信度达到可信度阈值，则基于所述中间晶体结构构建所述目标水通道蛋白的所述目标水通道蛋白模型；其中，在所述得到细胞膜模型之前，所述方法还包括：确定所述目标水通道蛋白模型对应的细胞类型中脂质的成分比例，根据所述成分比例构建所述目标膜模型；其中，所述成分比例包括：磷脂酰胆碱、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰丝氨酸、磷脂酰肌醇、胆固醇、鞘磷脂中的多个的混合比例；其中，在所述得到细胞膜模型之后，所述方法还包括：基于所述细胞膜模型构建目标膜结构；其中，所述目标膜结构包括两个所述细胞膜模型、中间介质、外侧介质；所述中间介质为两个所述细胞膜模型之间填充的介质，所述外侧介质为两个所述细胞膜模型的外侧填充的介质；相应的，所述统计不同预设跨膜参数下，待处理氧自由基穿过所述细胞膜模型中的所述目标水通道蛋白模型的统计数量，包括：统计不同预设跨膜参数下，所述待处理氧自由基由所述外侧介质运动至所述中间介质的统计数量；其中，所述跨膜电压为所述外侧介质和所述中间介质之间的电压，所述氧自由基浓度差为所述外侧介质和所述中间介质之间的氧自由基的浓度差。

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