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申请/专利权人:北京金匙医学检验实验室有限公司;天津金匙医学科技有限公司;金匙智造(天津)医疗科技有限公司
摘要:本申请提供了一种使宏基因组文库片段大小集中的文库构建方法,所述方法使用优化的酶切消化法搭配反应增强液来构建文库体系,具有样本兼容性高和体系稳定性好等优势,能够提高文库定量准确性,提高混样均一性和数据均一性。
主权项:1.一种使宏基因组文库片段大小集中的文库构建方法,其特征在于,所述方法包括:1核酸提取:取感染宏基因组样本进行核酸提取;2文库构建:a、核酸片段化;b、接头连接;c、接头产物纯化;d、纯化产物扩增;所述a、核酸片段化步骤具体为:取一定起始量的核酸提取样本,加入片段化酶FEAEnzyme、EB洗脱液和反应增强液进行酶切反应;所述反应增强液中包括Tris-HCl、C6H5O7Na3、BSA、MgCH3COO2.4H2O、MgCl2、CaCl2、BaCl2、MnCl2、NaCl、KCl、Na2HPO4、KH2PO4和NH4H2PO4;所述反应增强液中主要成分浓度如下: 离子名称 离子终浓度 C6H5O7Na3 0.25-0.1mgmL Mg2+ 10-30mM Ca2+ 5-15mM Ba2+ 0.05-1.5mM Mn2+ 0.05-1.5mM Na+ 15-40mM K+ 0.1-0.5mM NH4+ 0.3-0.6mM BSA 0.075-0.15mgml 所述一定起始量的核酸提取样本为1-60ng的核酸提取样本;所述反应增强液终浓度为1-50nmol;所述酶切反应的温度为35-37℃,反应时间为15-20min;所述感染宏基因组样本选自肺泡灌洗液、血液、痰液和脑脊液;所述文库构建方法使片段大小保持在300-400bp范围内,使文库峰形稳定;所述文库构建是针对二代MGI测序平台的文库构建。
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