申请/专利权人：加州理工学院

申请日：2018-12-07

公开（公告）日：2024-04-26

公开（公告）号：CN111699268B

主分类号：C12Q1/6841

分类号：C12Q1/6841

优先权：["20171208 US 62/596,337"]

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.26#授权;2020.10.20#实质审查的生效;2020.09.22#公开

摘要：本发明尤其提供了用于检测和或定量细胞、组织、器官或生物体中的核酸的技术。本发明通过顺序编条形码提供了用于对大量的靶诸如转录物和或DNA基因座进行高通量谱分析的方法。在一些实施方案中，核酸探针包含经由可裂解接头与结合序列连接的信号部分。

主权项：1.一种顺序杂交方法，所述方法包括：a使靶核酸分子与多于一种一级探针接触，其中每种一级探针包含：与所述靶核酸分子中的互补靶序列结合的一级结合序列，和与所述一级结合序列的一端连接的第一突出端序列，所述第一突出端序列包含一个或更多个结合靶，所述一个或更多个结合靶串联连接并且与所述一级结合序列连接；b使所述靶核酸分子与第一多于一种读取探针接触，其中每种读取探针包含信号部分，并且其中每种读取探针与第一突出端序列相互作用，所述第一突出端序列与所述多于一种一级探针中的一级探针连接，其中在来自所述第一多于一种读取探针中的每种读取探针与所述一级探针的所述第一突出端序列相互作用后，所述信号部分能够发射第一可检测视觉信号；c在步骤b之后对所述靶核酸分子成像，以便通过第一可检测视觉信号的存在来检测所述第一多于一种读取探针与所述多于一种一级探针之间的相互作用；d使所述靶核酸分子、所述多于一种一级探针和所述第一多于一种读取探针与包含变性剂的溶液接触，其中所述变性剂包含以30％和60％vv之间的浓度百分比存在于溶液中的甲酰胺，或以2M至5M的浓度存在于溶液中的尿素，其中所述溶液与所述靶核酸分子、所述多于一种一级探针和所述第一多于一种读取探针的接触不破坏所述多于一种一级探针与所述靶核酸分子之间的相互作用，但破坏所述多于一种一级探针与所述第一多于一种读取探针之间的相互作用，以允许去除所述第一多于一种读取探针；e使所述靶核酸分子与第二多于一种读取探针接触，其中每种读取探针包含信号部分，并且其中每种读取探针与一级探针的第二突出端序列相互作用，其中在来自所述第二多于一种读取探针中的每种读取探针与一级探针的第二突出端序列相互作用后，所述信号部分能够发射第二可检测视觉信号；和f在步骤e之后对所述靶核酸分子成像，以便通过所述第二可检测视觉信号的存在来检测所述第二多于一种读取探针与所述多于一种一级探针之间的相互作用。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 加州理工学院 通过用探针的快速切换和再杂交进行顺序杂交编条形码来多重标记分子

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