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一种鱼类鳃代谢组学样品前处理优化方法 

申请/专利权人:中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

申请日:2021-10-12

公开(公告)日:2024-05-03

公开(公告)号:CN114002345B

主分类号:G01N30/02

分类号:G01N30/02;G01N30/06;G01N30/72;G01N30/86

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.05.03#授权;2022.05.24#实质审查的生效;2022.02.01#公开

摘要:本发明公开了一种鱼类鳃代谢组学样品前处理优化方法,涉及代谢组学技术领域;它的优化方法如下:步骤一:准备仪器与试剂;步骤二:UPLC‑Q‑TOFMS数据采集与分析:样品的采集与制备;UPLC‑Q‑TOFMS分析;数据处理和统计分析;本发明采用UPLC‑Q‑TOFMS技术,研究对象为非靶向代谢组学鱼鳃组织样品,对前处理方法中涉及到的液相提取净化方法,进行了优化及方法学考察,基于覆盖率(检测到的潜在代谢物的数量)、稳定性(代谢物相对峰面积和保留时间的RSD)进行了分析讨论,同时利用QC样品开展了方法学考察,最终建立了适用于鱼鳃组织的UPLC‑Q‑TOFMS非靶向代谢组学样品前处理方法。

主权项:1.一种鱼类鳃代谢组学样品前处理优化方法,其特征在于:它的优化方法如下:步骤一:准备仪器与试剂:AcquityUPLC系统;色谱柱;SCIEXTripleTOF5600+高分辨质谱仪;AllegraX-30R高速离心机;组织研磨机;涡旋混匀器;KQ300DB型数控超声仪;XS205DY电子天平;Milli-QA10超纯水机;200μL、1000μL、5000μL移液器;甲醇、乙腈;甲醇、甲酸;麻醉剂;生理盐水;液氮;数据处理软件系统:ProgensisQI;MicrsoftOfficeExcel;GraphPadPrism8.0;步骤二:UPLC-Q-TOFMS数据采集与分析:2.1、样品的采集与制备:实验前,实验鱼在室内控温循环养殖设备中暂养1周,实验用水为过滤、曝气72h的自来水,水温为24±1℃,每天保持12-14h的光照条件,遵照三定三巡的模式管理;采样前24h停止喂食,将鱼转移至含有40mgL麻醉剂溶液中,深度麻醉后置于冰上解剖,快速取出鳃组织,用无菌生理盐水润洗,吸水纸擦干后用液氮速冻,再转移至-80°C冰箱保存待测;取出-80℃保存的鳃组织样品于4℃解冻,准确称重30mg,加入480μL甲醇和5个钢珠,用组织研磨机60Hz研磨30s,冰水浴超声处理10min,4℃下13000rpm离心15min,取300μL的上层溶液,过0.22μm有机相滤膜至进样瓶中待测;同时,将所有鳃组织等量混合,采用经优化后的鳃组织前处理方法制备QC样品,用于方法学考察;2.2、UPLC-Q-TOFMS分析:色谱分离过程在AcquityUPLC系统上进行,色谱柱为WatersAcquityUPLCBEHC18,预柱为AcquityUPLCBEHC18VanGuardPre-Column;液相条件:柱温为40℃,自动进样器温度为4℃;正离子扫描:流动相A为0.1%甲酸水溶液,B为乙腈;负离子扫描:流动相A为水,B为乙腈;梯度洗脱:0~4min,95%~30%A;4~11min,30%~15%A;11~12min,15%~0%A;12~13min,0%A;13~13.2min,0%~95%A;13.2~15min,95%A,流速设为0.3mLmin;质谱条件:在正负离子模式下扫描数据,正负离子源电压为5500V-4500V,离子源温度为550℃,裂解电压为80V-80V,碰撞能量为35eV-35eV,碰撞能量扩展为15eV;氮气用作雾化气体和辅助气体,Gas1和Gas2的压力为55PSI,气帘气压力为35PSI;开启动态背景扣除,并设置IDA响应值超过100cps的8个峰用于二次质谱扫描;一级质谱的母离子和子离子扫描范围为50-1500Da,进样量10μL;2.3、数据处理和统计分析:将UPLC-Q-TOFMS获得的原始数据导入ProgensisQI软件,以完成峰对齐、峰识别、滤噪、峰匹配等数据预处理,使用峰面积对原始数据进行归一化处理,并输出由保留时间、精确质核比、样品名称及峰强度等信息组成的二维矩阵数据;使用MicrsoftOfficeExcel、GraphPadPrism8.0软件对各预处理方法获得的数据结果进行统计分析。

全文数据:

权利要求:

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