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申请/专利权人：中国医学科学院北京协和医院
申请日：2024-05-21
公开（公告）日：2024-06-18
公开（公告）号：CN118212987A
主分类号：G16B30/00
分类号：G16B30/00;G16B50/10;G16B30/20
优先权：
专利状态码：在审-公开
法律状态：2024.06.18#公开
摘要：本发明提供了一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备，涉及基因技术领域，该方法包括：获取待测样本的测序数据；对测序数据进行预处理，获得目标测序数据；将目标测序数据与物种数据库进行比对，获得目标物种序列数据集，对目标物种序列数据集进行序列组装，获得组装结果；对组装结果进行基因预测，获得基因预测结果；对各个基因预测结果进行去冗余处理，得到各个非冗余基因序列；将每个非冗余基因序列与耐药基因数据库进行比对，获得每个非冗余基因序列对应的注释结果；基于每个非冗余基因序列对应的注释结果在各个非冗余基因序列中确定出耐药基因序列。应用本发明实施例提供的方法，能够准确地确定出耐药基因序列。
主权项：1.一种基因数据处理方法，其特征在于，包括：获取待测样本的各个测序数据；对各个所述测序数据进行预处理，获得各个目标测序数据；将各个所述目标测序数据与所述待测样本对应的物种数据库进行比对，获得目标物种序列数据集，所述目标物种序列数据集包括至少一个目标物种序列，所述目标物种序列包括各个所述目标测序数据中与所述目标物种数据库比对成功的目标测序数据；对所述目标物种序列数据集进行序列组装，获得组装结果；对所述组装结果进行基因预测，获得预测结果信息，所述预测结果信息至少包括多个基因预测结果；对所述预测结果信息中的各个所述基因预测结果进行去冗余处理，得到各个非冗余基因序列；将每个所述非冗余基因序列与预设的耐药基因数据库进行比对，获得每个所述非冗余基因序列对应的注释结果；所述注释结果包括序列相似度、覆盖度和比对阈值中的至少一种评估指标；基于每个所述非冗余基因序列对应的注释结果在各个所述非冗余基因序列中确定出耐药基因序列。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国医学科学院北京协和医院 一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备
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