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申请/专利权人：晶泰智药技术(上海)有限公司
申请日：2024-03-25
公开（公告）日：2024-06-21
公开（公告）号：CN118230851A
主分类号：G16C20/50
分类号：G16C20/50;G16B15/30
优先权：
专利状态码：在审-公开
法律状态：2024.06.21#公开
摘要：本申请提供了PROTAC分子的评价方法及系统、筛选方法及系统、设备、介质，解决了现有技术中预测三元复合物的工具均只能模拟三元复合物，但是并不能对模拟出来的三元复合物进行打分或者预测其降解能力的技术问题。PROTAC分子的评价方法，充分理解PROTAC分子的药理与传统小分子的占位驱动的药理学不同，主要是事件驱动的，无需进行PROTAC分子与目标靶点蛋白和目标E3蛋白的长时间和高强度结合，通过分子对接技术，和或分子动力学模拟技术，显著降低了现有技术中PROTAC分子评价过程中的计算资源消耗，降低了计算成本，同时提升了评价效率，从而能够更好的指导PROTAC的合理设计，加速PROTAC药物发现项目的推进。
主权项：1.一种PROTAC分子的评价方法，其特征在于，包括：计算候选PROTAC分子、目标靶点蛋白、目标E3蛋白在分子对接过程中形成的稳定的三元复合物构象占所有三元复合物构象的比例；当所述稳定的三元复合物构象占所有三元复合物构象的比例大于预设比例时，确定所述候选PROTAC分子为目标PROTAC分子；和或基于所述候选PROTAC分子的活性构象进行能量最小化，得到候选PROTAC分子的低能构象；计算候选PROTAC分子的活性构象的静电能和候选PROTAC分子的低能构象的静电能的差值；当所述差值小于预设差异值时，确定候选PROTAC分子为目标PROTAC分子。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 晶泰智药技术(上海)有限公司 PROTAC分子的评价方法及系统、筛选方法及系统、设备、介质
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