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申请/专利权人：哈尔滨工业大学
摘要：本发明公开一种基于稀疏编码的细胞基因表达量复现方法及系统，涉及生命科学领域的细胞基因表达量测定技术领域，方法包括：根据基因字典和被测细胞的基因维度，确定随机测量矩阵；根据随机测量矩阵和被测细胞的基因维度，确定随机测量矩阵对应的多组基因名称组；针对所述随机测量矩阵对应的每组基因名称组，根据所述基因名称组确定PCR引物组；基于PCR引物组，对被测细胞进行多重PCR反应，以确定被测细胞的多个Ct数据集合；针对每个Ct数据集合，根据Ct正值和Ct负值进行相对量计算，确定基因观测值；根据多个基因观测值和基因字典，计算被测细胞的基因表达量。本发明提高了细胞基因表达量的测定精准度。
主权项：1.一种基于稀疏编码的细胞基因表达量复现方法，其特征在于，所述细胞基因表达量复现方法包括：根据基因字典和被测细胞的基因维度，确定随机测量矩阵；所述随机测量矩阵包括0值、正值和负值；所述基因字典是基于非负矩阵分解算法，采用样本集进行字典训练得到的，所述基因字典的训练过程，具体包括：通过非负矩阵分解算法对样本集中多个样本细胞的多维度基因测序数据进行非负分解，以得到基因字典矩阵和基因活跃度矩阵；对所述基因字典矩阵和所述基因活跃度矩阵分别进行迭代优化；当迭代次数达到设置迭代次数时，多次迭代后的基因字典矩阵和基因活跃度矩阵构成基因字典；所述样本集包括多个样本；每个所述样本包括样本细胞的多维度基因测序数据；根据所述随机测量矩阵和所述被测细胞的基因维度，确定所述随机测量矩阵对应的多组基因名称组；每组所述基因名称组包括正值基因名称小组和负值基因名称小组；所述基因名称组的组数量与所述随机测量矩阵的行数相同；针对所述随机测量矩阵对应的每组基因名称组，根据所述基因名称组确定PCR引物组；基于所述PCR引物组，对所述被测细胞进行多重PCR反应，以确定所述被测细胞的多个Ct数据集合；每个所述Ct数据集合包括Ct正值和Ct负值；针对每个所述Ct数据集合，根据所述Ct正值和所述Ct负值进行相对量计算，确定基因观测值；根据多个所述基因观测值和所述基因字典，计算所述被测细胞的基因表达量。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 哈尔滨工业大学 一种基于稀疏编码的细胞基因表达量复现方法及系统
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