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申请/专利权人：烟台大学
摘要：本发明属于生物信息学技术领域，具体涉及一种急性髓系白血病预后模型的构建方法、系统，通过进行差异表达分析，得到批次效应较小的共有差异表达基因后，经加权基因共表达网络分析，识别出与临床性状相关性高的模块来作为关键模块，依次经单因素分析、回归算法分析、逐步回归分析，分析关键模块中基因表达水平对生存时间的影响，得到7个目标预后标志物，为CD2、LRG1、ANGPT1、CSTB、ST6GALNAC4、LSP1、AC135279.2，来构建急性髓系白血病预后模型，能够更准确地预测急性髓系白血病患者的生存期。
主权项：1.一种急性髓系白血病预后模型的构建方法，其特征在于，包括以下步骤：S1：采集急性髓系白血病患者的骨髓样本，计算转录本表达量，构建第一数据集；获取数据库中急性髓系白血病患者的转录组数据和临床数据，构建第二数据集；获取数据库中健康人群的转录组数据，构建第三数据集；S2：经差异表达分析，得到共有差异表达基因集；S3：共有差异表达基因集经加权基因共表达网络分析，得到若干个关键模块，具体为：基于共有差异表达基因集，计算共有差异表达基因之间的皮尔逊相关系数，根据共有差异表达基因之间的皮尔逊相关系数，构建加权邻接矩阵，将加权邻接矩阵转换为拓扑重叠矩阵后，计算拓扑重叠矩阵的不相似度，根据不相似度，共有差异表达基因进行聚类，构建基因-模块的向量聚类图，得到若干个模块和每个模块中的特征基因；计算每个模块中的特征基因与临床数据之间的皮尔逊相关系数，将皮尔逊相关系数大于皮尔逊相关系数阈值且P值小于第一P值阈值的特征基因所在模块，记为关键模块，遍历所有模块后，得到若干个关键模块；S4：若干个关键模块中的基因经单因素分析，计算每个基因的风险比和预设置信区间后，将P值小于第二P值阈值的基因，记为第一预后标志物；S5：第一预后标志物经回归算法分析，将似然偏差小于似然偏差阈值的基因，记为第二预后标志物；第二预后标志物经逐步回归分析，得到目标预后标志物和目标预后标志物的权重系数；S6：基于目标预后标志物和目标预后标志物的权重系数，构建急性髓系白血病预后模型。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 烟台大学 一种急性髓系白血病预后模型的构建方法、系统
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