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申请/专利权人:诸城市浩天生物科技有限公司
摘要:本发明公开了一种突变体表达菌株及D‑阿洛糖的合成方法,涉及生物技术领域,通过表达菌株构建,得168::pP43NMK‑LRI,然后对了E53、H94、A142、E273这四个位点进行位点突变,得到的突变体E53D、H94A、A142G、E273D、H94AA142G、H94AA142GE53D、H94AA142GE53DE273D相对酶活力分别提高了1.2倍、1.85倍、1.18倍、1.4倍、2.1倍、2.5倍、2.73倍大大提高了D‑阿洛糖的转化效果。
主权项:1.一种突变体表达菌株的制备方法,其特征在于包括以下步骤:S1、表达菌株构建S1-01、引物F1:AACTGCAGATGTACCTGTATAACAAAGATR1:GGGGTACCTTATTTACGCAGGGACAGCACTS1-02、载体pP43NMK-LRI构建目的基因LRI获得2×高保真酶mix50μL,模板1μL,F12μL,R12μL,ddH2O补齐100μL,反应程序:98℃预变性2min;98℃变性20s,降温至退火温度55℃退火20s,72℃延伸1min,共30个循环;72℃延伸10min,4℃保温,其后进行PCR产物纯化;双酶切体系及反应条件对质粒pP43NMK和目的基因LRI分别进行pstIkpnI双酶切,10*buffer5μL,BSA2μL,pstIkpnI22μL,DNA20μL,ddH2O19μL,共50μL,37℃酶切1h,回收目的载体片段约为7500bp,目的基因片段约为1200bp;T4DNA连接酶反应体系及条件载体DNA1μg,目的片段2μg,T4连接酶1μL,10×T4连接酶Buffer1μL,ddH2O补齐10μL,16℃连接2h;化学转化取10μL连接产物加入DH5α感受态细胞后,冰浴30min,42℃热激90s,冰浴2min,加入600μL无抗LB液体培养基,37℃低速、160~180rpm下孵育60min,涂布于LBAmp100μgmL抗性平板;克隆菌株阳性克隆子筛选菌落PCR验证后,提质粒送华大基因测序验证,得载体pP43NMK-LRI;S1-03、表达菌株制备电转化取1μL测序正确的载体pP43NMK-LRI,加到表达菌株Bacillussubtilis168感受态中,混匀,加入到预冷的电击杯中,将电击杯插入电转化仪上,设置好电压2.5KV,电击,电击结束加入500μL无抗LB液体培养基,转移至1.5mLEP管中,37℃、180rpm孵育1h,涂布于LBAmp100μgmL抗性平板;表达菌株阳性克隆子筛选LB抗性平板上的菌落PCR验证后,进行表达转化验证,将验证后的菌命名为168::pP43NMK-LRI,保存在-80℃冰箱;S2、突变体表达菌株制备S2-01、突变位点筛选通过AlphaFold进行位点预测,LRI预测到的关键位点有E53、H94、A142、E273,氨基酸序列第53位谷氨酸突变为天冬氨酸,氨基酸序列第94位组氨酸突变为丙氨酸,氨基酸序列第142位丙氨酸突变为甘氨酸,氨基酸序列第273位谷氨酸突变为天冬氨酸;S2-02、引物 S2-03、突变PCR体系及程序5×PhusionHFbuffer2μL,dNTP2.5mmolL0.8μL,DNA模板0.2μL,FR各0.3μL,DMSO0.3μL,Phu高保真DNA聚合酶2UμL0.1μL,ddH2O6μL,总体积10μL;预变性:98℃变性3min;扩增循环:98℃变性10s,55℃退火30s,72℃延伸4.5min,循环32次;补齐:72℃延伸10min;S2-04、DpnI消化模板体系10μL及反应条件10×buffer1μL,DNAPCR产物8μL,DpnI1μL;37℃、1h;S2-05、化学转化将PCR产物在37℃经DpnI消化模板质粒1h后,取10μL加入大肠杆菌DH5α感受态,冰浴30min,42℃水浴热激90s,冰上静置5min。加入600μLLB液体培养基,涂布于LBAmp100μgmL平板上,直至菌液被全部吸收,倒置平板,37℃培养12~16h,可见相应菌落;S2-06、克隆菌株阳性克隆子筛选提质粒送华大基因测序验证;S2-07、突变体及组合突变体质粒获得E53D:使用E53D引物,pP43NMK-LRI为模板,按照步骤S2-03~S2-06进行培养,得到E53D突变质粒,为质粒1;H94A:使用H94A引物,pP43NMK-LRI为模板,按照步骤S2-03~S2-06进行培养,得到H94A突变质粒,为质粒2;A142G:使用A142G引物,pP43NMK-LRI为模板,按照步骤S2-03~S2-06进行培养,得到A142G突变质粒,为质粒3;E273D:使用E273D引物,pP43NMK-LRI为模板,按照步骤S2-03~S2-06进行培养,得到E273D突变质粒,为质粒4;H94AA142G:使用A142G引物,质粒2为模板,按照步骤S2-03~S2-06进行培养,得到H94AA142G突变质粒,为质粒5;H94AA142GE53D:使用E53D引物,质粒5为模板,按照步骤S2-03~S2-06进行培养,得到H94AA142GE53D突变质粒,为质粒6;H94AA142GE53DE273D:使用E273D引物,质粒6为模板,按照步骤S2-03~S2-06进行培养,得到H94AA142GE53DE273D突变质粒,为质粒7;S2-08、突变体表达菌株制备将测序正确的突变体质粒1~7,分别电转化到表达菌株Bacillussubtilis168中,方法同步骤S1-03,转化成功的突变体表达菌株分别命名为168::pP43NMK-LRI-E53D、168::pP43NMK-LRI-H94A、168::pP43NMK-LRI-A142G、168::pP43NMK-LRI-E273D、168::pP43NMK-LRI-H94AA142G、168::pP43NMK-LRI-H94AA142GE53D、pP43NMK-LRI-H94AA142GE53DE273D,保藏在-80℃冰箱。
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