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NMIBC预后预测分子标志物、筛选方法及建模方法 

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申请/专利权人:上海交通大学医学院附属仁济医院

摘要:本发明公开了一种NMIBC预后预测分子标志物的筛选方法,该方法根据NMIBC患者的临床信息进行分组,利用转录组数据筛选不同分组差异表达基因进行聚类分析,以差异基因群的标准化表达值为分子特征筛选预后预测分子标志物。本发明还公开了NMIBC预后预测模型的构建方法。本发明通过NMIBC患者转录组高通量测序数据,结合差异分析、聚类模式识别和机器学习特征选择等方法,筛选出与NMIBC恶性进展为MIBC高度相关的分子预测标志物,根据标志物基因表达数据对NMIBC患者是否向MIBC恶性进展及进展快慢的肿瘤病变阶段进行分子预测分析,从而为NMIBC恶性进展的动态监控和预后提供了快速、有效、无创的分子检测方法。

主权项:1.非肌层浸润型膀胱癌预后预测分子标志物的筛选方法,其特征在于,步骤包括:获取NMIBC患者样本的转录组数据和临床信息,根据NMIBC进展情况分组;将转录组基因表达谱数据转化为原始readscount表达谱数据;筛选不同分组之间的差异表达基因;对所述差异表达基因的readscount表达谱数据进行标准化;基于所述差异表达基因的标准化表达值对所述NMIBC患者样本进行聚类分析,获得差异基因群;以所述差异基因群的标准化表达值作为分子特征,利用机器学习分类算法,筛选NMIBC预后预测分子标志物。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 上海交通大学医学院附属仁济医院 NMIBC预后预测分子标志物、筛选方法及建模方法

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