申请/专利权人：北京悦康科创医药科技股份有限公司

申请日：2024-03-29

公开（公告）日：2024-06-25

公开（公告）号：CN117976074B

主分类号：G16C10/00

分类号：G16C10/00;G16B30/00;G16B40/00;G06F18/214

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.06.25#授权;2024.05.21#实质审查的生效;2024.05.03#公开

摘要：本发明涉及生物医药技术领域，公开了一种MHC分子和抗原表位亲和力确定方法、模型训练方法及装置，其中，MHC分子和抗原表位亲和力确定方法包括：获取待确定亲和力的MHC分子序列和抗原表位序列；根据所述MHC分子序列和所述抗原表位序列，获取序列对相关信息；基于所述MHC分子序列和所述抗原表位序列，获取描述符对相关信息；利用预先训练的亲和力预测模型，基于所述序列对相关信息、和所述描述符对相关信息，进行MHC分子和抗原表位亲和力预测，输出预测结果。本发明能够提高MHC分子和抗原表位亲和力的预测准确度。

主权项：1.一种MHC分子和抗原表位亲和力确定方法，其特征在于，所述方法包括：获取待确定亲和力的MHC分子序列和抗原表位序列；根据所述MHC分子序列和所述抗原表位序列，获取序列对相关信息；基于所述MHC分子序列和所述抗原表位序列，获取描述符对相关信息；利用预先训练的亲和力预测模型，基于所述序列对相关信息、和所述描述符对相关信息，进行MHC分子和抗原表位亲和力预测，输出预测结果；其中，所述根据所述MHC分子序列和所述抗原表位序列，获取序列对相关信息，包括：分别将所述MHC分子序列和所述抗原表位序列进行词元切分，得到对应的MHC分子词元序列、抗原表位词元序列；将所述MHC分子词元序列与所述抗原表位词元序列进行拼接，得到拼接词元序列；将所述拼接词元序列中的每个词元进行嵌入特征表示，得到所述序列对相关信息；在模型训练阶段，统计所有样本对应的拼接词元序列中出现的词元，并统计各不同词元在所有样本对应的拼接词元序列中的出现次数，然后基于统计出的词元生成词元字典，词元字典中的键按照词元的出现次数由高到低进行排序；词元共计22个；所述亲和力预测模型包括第一特征提取模块、第二特征提取模块和预测模块；所述利用预先训练的亲和力预测模型，基于所述序列对相关信息、和所述描述符对相关信息，进行MHC分子和抗原表位亲和力预测，输出预测结果，包括：所述第一特征提取模块对所述序列对相关信息进行特征提取，得到序列对特征；所述第二特征提取模块对所述描述符对相关信息进行特征提取，得到描述符对特征；所述预测模块基于所述序列对特征和所述描述符对特征，得到所述MHC分子和抗原表位亲和力的预测结果；所述第一特征提取模块为Star-Transformer模型；和或，所述第二特征提取模块为VisionTransformer模型。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 北京悦康科创医药科技股份有限公司 MHC分子和抗原表位亲和力确定方法、模型训练方法及装置

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。

阅读全文 双屏查看 官方信息 专利公告 收藏专利 下载PDF 下载WORD