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分子表示方法、分子表示模型的训练方法及装置 

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申请/专利权人:北京百度网讯科技有限公司

摘要:本公开提供了一种分子表示方法、分子表示模型的训练方法及装置,涉及人工智能技术领域,尤其涉及生物计算、深度学习技术领域。实现方案为:获取待表示的分子的特征信息,所述分子包括多个原子;生成所述多个原子的全连通图,所述全连通图包括多条边;基于所述特征信息,生成多个原子向量表示和多个边向量表示,所述多个原子向量表示与所述多个原子分别对应,所述多个边向量表示与所述多条边分别对应;基于所述全连通图,对所述多个原子向量表示和所述多个边向量表示进行至少一次聚合,以得到更新后的多个原子向量表示;以及基于所述更新后的多个原子向量表示,生成所述分子的分子向量表示。

主权项:1.一种分子表示方法,包括:获取待表示的分子的特征信息,其中,所述分子包括多个原子;生成所述多个原子的全连通图,其中,所述全连通图包括多条边;基于所述特征信息,生成多个原子向量表示和多个边向量表示,其中,所述多个原子向量表示与所述多个原子分别对应,所述多个边向量表示与所述多条边分别对应;基于所述全连通图,对所述多个原子向量表示和所述多个边向量表示进行至少一次聚合,以得到更新后的多个原子向量表示,所述至少一次聚合的每一次聚合包括:对于所述多个原子中的任一原子,基于注意力机制将当前的多个原子向量表示和当前的多个边向量表示进行聚合,以得到该原子的更新后的原子向量表示;以及对于所述多条边中的任一边:基于该边所连接的两个原子的更新后的原子向量表示,对该边当前的边向量表示进行更新,以得到该边的第一边向量表示;以及基于注意力机制将所述多条边的多个第一边向量表示进行聚合,以得到该边的更新后的边向量表示;以及基于所述更新后的多个原子向量表示,生成所述分子的分子向量表示,其中,所述基于所述全连通图,对所述多个原子向量表示和所述多个边向量表示进行至少一次聚合,以得到更新后的多个原子向量表示的步骤和所述基于所述更新后的多个原子向量表示,生成所述分子的分子向量表示的步骤通过经训练的分子表示模型实现。

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