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一种基于PacBio三代测序平台的mRNA 3’末端文库构建方法 

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申请/专利权人:深圳大学

摘要:本发明涉及核酸测序领域,具体涉及一种基于PacBio三代测序平台的mRNA3’末端文库构建方法,解决了mRNA的3′末端修饰问题。通过Sera‑MagOligodTBead方法纯化mRNA,并在纯化后的mRNA3’末端添加接头序列,以及利用Templateswitcholigo的方法得到包含转录物的完整5'端和3’端的反转录cDNA,并且选择3’通用引物和5'通用引物进行PCR扩增,从而获得完整的双链cDNA,T‑A克隆并测序发现能够检测到polyA尾端;最后,在3’通用引物和5'通用引物的5’端加上Index序列并进行PCR扩增,将PCR扩增产物进行PacBioSequelⅡCCS测序,产出符合要求且稳定的测序数据。本发明可以检测polyA尾3′最末端的序列,测序准确率高。

主权项:1.一种基于PacBio三代测序平台的mRNA3’末端文库构建方法,其特征在于,方法如下:通过Sera-MagOligodTBead方法纯化mRNA,并在纯化后的mRNA3’末端添加接头序列,以及利用Templateswitcholigo的方法得到包含转录物的完整5'端和3’端的反转录cDNA,并且选择3’通用引物和5'通用引物进行PCR扩增,从而获得完整的双链cDNA,T-A克隆并测序发现能够检测到polyA尾端;最后,在3’通用引物和5'通用引物的5’端加上Index序列并进行PCR扩增,将PCR扩增产物进行PacBioSequelⅡCCS测序,产出符合要求且稳定的测序数据。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 深圳大学 一种基于PacBio三代测序平台的mRNA 3’末端文库构建方法

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