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申请/专利权人：中国科学院昆明动物研究所
申请日：2024-04-15
公开（公告）日：2024-06-21
公开（公告）号：CN118222685A
主分类号：C12Q1/6869
分类号：C12Q1/6869;C12Q1/6806;C40B50/06
优先权：
专利状态码：在审-公开
法律状态：2024.06.21#公开
摘要：本发明属于细胞工程技术领域，涉及一种适用于生物样本中微量RNA病原核酸的靶向捕获测序技术，主要针对酒精保存的这一类RNA降解严重的样本，采用现有技术的靶向捕获测序方法，捕获效率低，甚至检测不到目标病原的基因组序列。本发明通过提取样本的RNA构建cDNA文库，设计改进的目标病原基因组的探针，构建探针捕获的文库，进行二代测序，通过评估目标病原基因组的覆盖度计算靶向捕获测序技术的捕获效率。结果显示，采用本发明的方法，捕获效率可达95％，效率提升了20％，同时，还节约了成本，对于RNA降解严重的样本的病原鉴定具有重要的作用和意义。
主权项：1.一种适用于生物样本中微量RNA病原核酸的靶向捕获测序方法，包括以下步骤：S1提取酒精保存的RNA降解严重样本的病原RNA；提取样本RNA时，添加PolyAcarrier试剂；S2使用S1得到的病原RNA，构建链特异的cDNA文库；S3利用S2得到的cDNA文库进行杂交捕获文库构建；基于目标病原序列设计特异性的探针，所述的探针的长度为100nt-150nt；并对S2步骤得到的cDNA文库进行杂交捕获文库构建，对目标病原序列进行准确且高效的富集，构建探针捕获的文库；S4对探针杂交捕获文库进行高通量测序。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国科学院昆明动物研究所 一种适用于生物样本中微量RNA病原核酸的靶向捕获测序方法
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