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申请/专利权人：青岛华大基因研究院
申请日：2022-12-27
公开（公告）日：2024-06-28
公开（公告）号：CN118262790A
主分类号：G16B30/10
分类号：G16B30/10;G16B40/00
优先权：
专利状态码：在审-公开
法律状态：2024.06.28#公开
摘要：本申请提供了共标签测序数据的序列比对方法和装置，包括：将共标签测序数据按照读长携带的标签拆分到指定个数的第一集合中；将每个第一集合包含的所有读长分别比对到参考基因组中，根据得到的每个第一集合包含的所有读长的初始比对信息，确定每个第一集合包含的每个标签下的唯一比对读长信息和多比对读长信息以及比对位置；根据每个第一集合包含的每个标签下的所有唯一比对读长信息的唯一比对位置，确定每个第一集合包含的每个标签对应的长片段区间；根据每个第一集合包含的每个标签对应的长片段区间，从每个第一集合包含的每个标签下的每个多比对读长信息的多比对位置中确定真实比对位置。本申请提高了解决多比对的效率。
主权项：1.一种共标签测序数据的序列比对方法，其特征在于，包括：将共标签测序数据按照读长携带的标签拆分到指定个数的第一集合中，其中，任一个所述第一集合由至少一个所述标签下的第一读长组成，或，由至少一个所述标签下的第一读长和与所述第一读长构成读长对的第二读长组成；将每个所述第一集合包含的所有读长分别比对到参考基因组中，得到每个所述第一集合包含的所有读长的初始比对信息；根据每个所述第一集合包含的所有读长的初始比对信息，确定每个所述第一集合包含的每个标签下的唯一比对读长信息和多比对读长信息，以及所述唯一比对读长信息的唯一比对位置和所述多比对读长信息的多比对位置，其中，在所述第一集合仅由所述第一读长组成的情况下，所述唯一比对读长信息为唯一对比读长，所述多比对读长信息为多比对读长，在所述第一集合由所述第一读长和所述第二读长组成的情况下，所述唯一比对读长信息为唯一比对读长对，所述多比对读长信息为多比对读长对；根据每个所述第一集合包含的每个标签下的所有唯一比对读长信息的唯一比对位置，确定每个所述第一集合包含的每个标签对应的长片段区间；根据每个所述第一集合包含的每个标签对应的长片段区间，从每个所述第一集合包含的每个标签下的每个多比对读长信息的多比对位置中确定真实比对位置。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 青岛华大基因研究院 一种共标签测序数据的序列比对方法和装置
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