买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！

申请/专利权人：北京中大唯信科技有限公司

摘要：本发明涉及计算机辅助药物研发技术领域，具体涉及一种高效分子三维构象的表达方法，该方法包括步骤A、建立基础片段库辅助文件；步骤B、构建分子三维构象；步骤C、记录生成分子三维构象的元数据以及步骤D、元数据的压缩存储。本发明避免了显式地记录每个分子构象中各原子的三维坐标，而是记录了高效还原每个构象三维坐标的meta信息，由于meta信息的存储量要比三维构象的显式表达要小100‑1000倍，而meta数据还原三维坐标的速度要比最快的三维构象生成的算法还要快一个数量级以上。由此，该方法突破了超大规模化学分子数据库的分子三维构象的存储限制，为药物分子的三维筛选提供了有效解决手段。

主权项：1.一种高效分子三维构象的表达方法，其特征在于：包括以下步骤：步骤A、建立基础片段库辅助文件，以获得所有三维构象元数据文件中所需参考的基础片段的三维结构数据；步骤B、基于分子片段组装技术构建分子三维构象；步骤C、记录生成分子三维构象的元数据，所述元数据包含以下信息：1构成分子的基础片段信息，包括基础片段的哈希代码、基础片段的构象数；2基础片段的连接关系，包括每个子片段连接涉及的基础片段、连接的原子指标和连接键的旋转刻度；3基础片段间合理构象组合的标示：构成子片段的两个基础片段各自的三维构象以怎样的旋转角度组合是合理的；4每个基础片段当前步骤中在后续连接步骤中还可用的连接键；5每个基础片段的连接键对应的可用于确定该基础片段沿该连接键旋转角度的锚定原子；6由基础片段组合成子片段中原子指标的映射关系；7整体分子的构象数量以及各个构象能量；8整体分子的原子顺序以及原子键连信息和立体信息；9分子的药效团信息；步骤B包括以下步骤：B1、从基础片段的三维构象组合成较大的子片段1组合成子片段AB的两个基础片段分别定义为基础片段a和基础片段b，基础片段a由基础片段库中选取Na个合理三维结构，基础片段b由基础片段库中选取Nb个合理三维结构；2基础片段A与基础片段B以一个可旋转的单键连接，并通过Nr个旋转刻度，Nr取值10～30，每个旋转刻度为360Nr度，得到Na*Nb*Nr个可能的构象组合；3从Na*Nb*Nr个构象组合中过滤掉高能量的不合理构象，保留Nab个三维结构作为组合而成的子片段AB的合理三维构象；B2、按照步骤B1获得所有组合而成的子片段的合理三维构象；B3、对所有组合而成的子片段的合理三维构象，按照步骤B1的方法，直到完成整个分子的三维构象。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 北京中大唯信科技有限公司 一种高效分子三维构象的表达方法