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申请/专利权人：中南大学湘雅医院;杭州迪谱医学检验实验室有限公司
摘要：本发明公开了一种纳米孔多重靶向微生物鉴定方法、系统、设备和介质，属于基于纳米孔测序的宏基因组学技术领域。本发明的方法和系统对嵌合序列进行拆分，可以检出更多的物种序列数，特别是对于某些低丰度或在扩增时容易发生嵌合的物种，检测灵敏度得到显著提升，进一步，本发明的方法和系统对纳米孔测序的错误进行校正得到一致性序列，进一步提升物种鉴定的精度和可信度。
主权项：1.一种纳米孔多重靶向微生物鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：S1，获得微生物多重靶向纳米孔测序数据；S2，将测序数据与微生物参考基因组进行比对，得到第一参考序列集，S3，对每一条测序序列分别作为query序列并进行如下处理：S31，将query序列的所有比对上的第一参考序列按照比对分值从高到低进行排序，取比对分值最高的第一参考序列称为hit0，S32，对剩余比对上的第一参考序列按比对分值从高到低依次进行如下分组处理：1如果该第一参考序列与query序列的比对区段和hit0与query序列的比对区段的重叠区域大于等于该第一参考序列与query序列的比对区段长度的20％，则将该第一参考序列与hit0归为同一组，2如果该第一参考序列与query序列的比对区段和hit0与query序列的比对区段的重叠区域小于该第一参考序列与query序列的比对区段长度的20％，则将该第一参考序列作为新的hit0，对剩余比对上的第一参考序列重复步骤S32，S33，提取每个分组比对分值最高的第一参考序列与query序列的比对区段对应的query序列作为query序列的子序列，S4，对于步骤S3获得的每一子序列，基于其对应分组中比对分值最高的第一参考序列进行物种分类，能够分类到的最低层级的物种作为该子序列的初始物种鉴定结果，以用于物种分类的第一参考序列比对的相似度和覆盖度的最低值作为该子序列比对到该物种的相似度和覆盖度。
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百度查询： 中南大学湘雅医院 杭州迪谱医学检验实验室有限公司 一种纳米孔多重靶向微生物鉴定方法、系统、设备和介质
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