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活细胞快速定位和观测生长周期的方法、系统及其应用 

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申请/专利权人:深圳市生强科技有限公司

摘要:本发明提出了活细胞快速定位和观测生长周期的方法、系统及其应用,通过XYZ三轴机械运动与智能相机协作,首先低倍镜下快速扫描并自动对焦拍摄染色活细胞,利用AI算法识别细胞位置。结合图像中心位置与像素尺寸,精确定位细胞坐标。随后,高倍镜依据坐标自动对焦拍摄细胞高清图像,并利用神经网络技术判别细胞所处生长周期阶段(G1、S、G2期或分裂期各阶段),实现自动分类标记。创新点包括荧光强度辅助自动对焦、AI驱动的细胞识别与精确定位,以及周期性自动观测设计,极大地提升了观测效率与数据分析精度,为细胞生物学研究带来创造性进步。

主权项:1.活细胞快速定位和观测生长周期的方法,其特征在于,包括以下步骤:S00、通过观测仪器XYZ三个轴进行机械运动带动相机的移动到观测区域后,首先使用低倍率镜获取初始的视野范围,并自动对焦到最清晰的位置,对已经进行染色的活细胞进行拍摄;S10、对拍摄的视野图片的每个像素进行荧光强度计算,并设置荧光强度的阈值;将荧光强度大于阈值的像素标记为细胞区域,将荧光强度小于等于阈值的像素标记为背景区域,以生成细胞区域掩膜;通过Canny算法对拍摄的视野图片进行边缘检测,以检测出细胞的边缘;将检测到的细胞边缘与细胞区域掩膜进行合并,以生成更精细的细胞区域掩膜;根据更精细的细胞区域掩膜,利用像素坐标计算出细胞的位置;S20、根据当前拍摄的视野图片的中心位置和相机的像素大小以及细胞距离视野图片中心位置的距离,计算出实际每个细胞的坐标位置;其中,细胞的坐标位置计算公式如下:实际位置的横坐标X=X1+[X2+PX2PX2]*DX实际位置的横坐标Y=Y1+[Y2+PY2PY2]*DY其中X1,Y1为拍摄视野图片的中心位置,PX,PY为相机的像素大小,X2,Y2为细胞在图像上的位置,DX和DY分别为每个像素的横向和纵向距离;S30、切换高倍率镜,根据每个细胞的实际坐标位置重新进行自动对焦,在对焦到的最清晰位置进行拍摄,得到高倍图像;其中S30步骤的自动对焦方式与S00步骤的自动对焦方式一致;S40、对所述高倍图像进行AI识别,以判断每个细胞处于的间期或者分裂期,并进行标记分类保存;其中,间期分为DNA合成前期、DNA合成期与DNA合成后期;分裂期分为前、中、后以及末期。

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