申请/专利权人:北京博富瑞基因诊断技术有限公司
申请日:2024-04-08
公开(公告)日:2024-05-31
公开(公告)号:CN118016160B
主分类号:G16B30/10
分类号:G16B30/10;G16B40/00
优先权:
专利状态码:有效-授权
法律状态:2024.05.31#授权;2024.05.28#实质审查的生效;2024.05.10#公开
摘要:本公开涉及一种HLA单倍体相合造血干细胞移植生存率的预测方法、系统、设备、存储介质。该预测方法包括S100、获取受体和供体的HLA基因分型;S200、根据受体和供体的HLA基因分型,获取受体和供体HLA基因之间错配基因所对应的两条氨基酸序列;S300、将受体和供体HLA基因之间错配基因所对应的两条氨基酸序列转化为二维向量;S400、计算受体和供体HLA基因之间错配基因的欧几里得距离;S500、基于欧几里得距离预测受体在接受HLA单倍体相合造血干细胞移植后的生存率。本公开通过欧几里得距离预测受体接受HLA单倍体相合造血干细胞移植的生存率,能够有效反映HLA丰富的功能多态性,研究结论具有应用价值。
主权项:1.一种HLA单倍体相合造血干细胞移植生存率的预测方法,所述HLA单倍体相合造血干细胞移植为受体HLA基因中的一条核苷酸序列和供体HLA基因中的一条核苷酸序列相同、且受体HLA基因中的另一条核苷酸序列和供体HLA基因中的另一条核苷酸序列不同,其中,受体HLA基因和供体HLA基因之间不同的两条核苷酸序列称为错配基因,其特征在于,所述预测方法包括以下步骤:S100、获取受体的HLA基因分型和供体的HLA基因分型;S200、根据受体的HLA基因分型和供体的HLA基因分型,获取受体HLA基因和供体HLA基因之间错配基因所对应的两条氨基酸序列;S300、将受体HLA基因和供体HLA基因之间错配基因所对应的两条氨基酸序列特征分别转化为二维向量;S400、计算受体HLA基因和供体HLA基因之间错配基因的欧几里得距离;其中,所述欧几里得距离为位于受体HLA基因和供体HLA基因之间错配基因所对应的两个二维向量之间的坐标距离;S500、基于所述欧几里得距离预测受体在接受HLA单倍体相合造血干细胞移植后的生存率;其中,所述欧几里得距离越大,则预测受体在接受HLA单倍体相合造血干细胞移植后的生存率越小;反之,所述欧几里得距离越小,则预测受体在接受HLA单倍体相合造血干细胞移植后的生存率越大。
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